거대한 유전 스크리닝 작업으로 유방암의 뿌리를 찾아냅니다
거대한 유전 스크리닝 작업으로 유방암의 뿌리를 찾아냅니다
과학자들은 종양을 키울 수있는 유전자 서열을 찾기 위해 수천 개의 유전자 서열을 탐색했다.
암 관련 유전자의 변이 약 4,000 종에 대한 방대한 연구는 유방암이나 난소 종양의 위험에 처한 사람들을 정확히 찾아내는 데 도움이 될 수 있습니다.
정보가 절실히 필요합니다. 수백만 명의 사람들이 BRCA1 유전자를 서열화했습니다. BRCA1 의 DNA 서열의 일부 변형은 유방암과 난소 암과 연관되어있다. 다른 사람들은 안전하다고 생각됩니다. 그러나 대부분의 변종의 영향은 알려지지 않았기 때문에 결과를 해석하기 위해 환자와 의사 모두 손실을 입었습니다.
9 월 12 일 네이처 1 에서 발표 된이 연구 는 실험실에서 자란 세포의 생존에 대한 수천 가지 변종의 영향을 조사했다. 이 발견은 의사들이 돌연변이의 중요성을 해석하는 데 도움이 될 수있다. 예를 들어 실험실에서 DNA를 복구 할 수있는 세포의 기능을 방해하는 변형도 클리닉의 암에 연결될 수 있습니다.
"모든 환자는 다릅니다. 모든 의사는 다르다. "라고 워싱턴 시애틀의 정밀 의학 연구소의 박티 바티 (Baty Baty) 연구소의 유전학자인 Jay Shendure는 말했다.이 연구의 공동 저자이기도하다. "그런 변종이 내 가족 구성원에 있다면이 정보를 사용할 수 있습니까? 전혀. 그렇지 않으면 정보가 없습니다. "
불확실한 미래
미국 유전학 및 유전체 학회 (American Genetics and Genomics)는 선별 검사를 통해 질병의 예방을위한 의료 계획을 제안 할 수있는 약 60 개의 유전자를 인식하고 있습니다. 그러나 흔히 사람들의 유전자가 비정상적인 DNA 서열을 포함한다는 것을 알게되면 그 발견을 해석하기가 어려워집니다.
플로리다 주 탬파에있는 모 피트 암 센터 (Moffitt Cancer Center)의 유전학자인 알바로 몬테 이로 (Alvaro Monteiro)는 "이 변종은 악몽 같은 것이다. "그 결과는 '글쎄, 너는 무언가를 가지고 있지만 그게 뭔지 정확히 알지 못한다.'
청각 손실의 유전 적 원인에 대한 분석은 주요한 예이다. 그러한 검사를받는 사람들의 약 절반이 중요성이 알려지지 않은 변종을 가지고 있다는 것을 알게되었다고 MIT의 Broad Institute의 유전 학자이자 매사추세츠 주 케임브리지의 하버드 (Harvard)의 유전 학자 인 Heidi Rehm은 말한다. . "모든 유전 실험 분야에서 확실한 도전입니다."라고 그녀는 말합니다.
들어 BRCA1 , 지분은 특히 높은 : 그 여자 BRCA1 순서 암의 위험을 둔다는 때로는 수술을해야합니다 자신의 가슴과 난소를 제거 할 수 있습니다. Rehm은 BRCA1 에서 2,500 가지 이상의 알려진 불확실성이있는 변종이 있다고합니다 .
넓은 그물을 던지기.
Shendure와 동료 Brotman Baty 연구소 유전 학자 Lea Starita는 DNA 수리에 중요한 BRCA1 단백질이 없어도 죽는 세포를 사용하여이 문제를 해결하기로 결정했습니다. 그들은 CRISPR-Cas9 유전자 편집을 사용하여 BRCA1 유전자 전체에 돌연변이를 일으킨 다음 생존 한 세포를 확인했습니다.
이 화면 은 관련 단백질의 기능에 중요한 것으로 알려진 BRCA1 부위의 거의 모든 단일 문자 변이를 다뤘습니다 . 임상 데이터가 이용 가능한 경우, 실험 결과는 임상 결과와 96 % 이상 상관 관계가있었습니다.
이 접근법은 다른 질병 관련 유전자, 특히 DNA 복구에 중요한 암 관련 유전자로 확대 될 수 있다고 Monteiro는 말한다.
이상적으로이 데이터는 특정 변형에 대한 다른 유전 정보와 결합되지만 희귀 서열에 대해서는 더 많은 데이터가 제공되지 않을 수 있습니다. 그러한 경우, 결과를 해석하는 방법을 결정하는 것은 환자와 의사에게 달려 있다고 Starita는 말합니다. 암 종양을 조기에 발견하기 위해 암에 대한 추가 검사를 실시 할 수도 있습니다.
결국 연구자들은 CRISPR 화면에서 파생 된 결과와 같은 실험 결과를 변형을 분류하는 데 사용하는 모델에 통합 할 수 있다고 Monteiro는 말합니다. 그러나 그는 또한이 분야가 보수적 인 경향이 있으며, 변화를 일으키기 전에 더 많은 증거를 요구할 것으로 보인다.
"이것은 매우 까다로운 주제입니다."라고 그는 말합니다. "변종을 분류하기 위해 한 번 시도 할 때 우리는 결코 변하지 않을 의사 결정을 정말 좋아합니다."